使用Jena将本体存入MySQL——文档和例子
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注明：本文档参考Jena 2.5文档，使用Jena 2.5 API和MySQL 5.0.4-beta-nt数据库。MySQL驱动包使用的是mysql-connector-java- 3.1.10-bin.jar。

Jena提供了将RDF数据存入关系数据库的接口，Model、Resource、Query等接口可以用于访问和维护数据库里的RDF数据。在处理数据时，应用程序不必直接操作数据库（而是通过Jena的API），也不必知道数据库的模式。
Jena提供了支持MySQL、HSQLDB、PostgreSQ、Oracle和Microsoft SQL Server的程序接口。有些第三方提供其他数据库接口的支持。
可以参考Jena数据库文档获得数据库版本以及对应的JDBC驱动说明。

关系数据库存储RDF数据的一般模式是“三元组”，表有三列（主体、谓词、客体）每个RDF陈述（sataement）占用一行。有时候，添加第四列以表示客体是字符常量还是URI。
Jena 2采用一种denormalized的三元组存储方法，是存储空间和访问时间的一种权衡方法（a space-time trade-off）。Jena使用两类七个表存储本体，第一类是asserted statements，第二类reified statements。
Statement Tables 陈述表
1) Asserted Statement Table (Jena_GiTj_Stmt)：存储本体数据
2) Reified Statement Table (Jena_GiTj_Reif)：经过处理的本体数据
System Tables 系统表：存储元数据和陈述表中使用的较长的文字或者资源
3) System Statement Table (Jena_Sys_Stmt)：存储系统元数据
4) Long Literals Table (Jena_Long_Lit)：存储陈述表中不便于直接存储的长字符创常量（Literals）
5) Long Resources Table (Jena_Long_URI)：存储陈述表中不便于直接存储的长资源URI
6) Prefixes Table (Jena_Prefix)：存储URI的前缀。前缀只存储一次，节省空间。
7) Graph Table (Jena_Graph)：存储每一个用户图的名字和唯一标志符。
8) Lock Table (Jena_Mutex)：一个没有内容的表。如果该表存在，在一定时间段里数据库被锁定。
可以参照\\Jena-2.5\doc\DB\layout.html获取各个表的详细信息。

Jena同时支持内存模型和数据库模型。一般来讲，创建内存模型只需要调用Jena的一些接口，但创建数据库模型，或者打开先前创建的模型，要求一些具体的步骤。
任何数据库的持久模型通过以下步骤创建：
1) 加载数据库JDBC驱动
2) 创建数据库连接
3) 为数据库创建一个ModelMaker
4) 为本体创建一个模型

使用Jena将本体存入MySQL中的OntoDatabase数据库。完整代码如下：
import java.io.*;
import java.sql.SQLException;
import com.hp.hpl.jena.db.*;
import com.hp.hpl.jena.rdf.model.*;
public class Onto2Database{
public static final String strDriver = "com.mysql.jdbc.Driver"; // path of driver class
public static final String strURL = "jdbc:mysql://localhost/OntoDB"; // URL of database
public static final String strUser = "root"; // database user id
public static final String strPassWord = "onto"; // database password
public static final String strDB = "MySQL"; // database type
public static void main(String[] args){
try{
// 创建一个数据库连接
IDBConnection conn = new DBConnection ( strURL, strUser, strPassWord, strDB );
// 加载数据库驱动类，需要处理异常
try{
Class.forName(strDriver);
}catch(ClassNotFoundException e) {
System.out.println("ClassNotFoundException, Driver is not available...");
}
// 使用数据库连接参数创建一个模型制造器
ModelMaker maker = ModelFactory.createModelRDBMaker(conn);
// 创建一个默认模型，命名为 MyOntology
Model defModel = maker.createModel("MyOntology");
// 准备需要存入数据库的本体文件，建立输入文件流
FileInputStream inputSreamfile = null;
try {
File file = newFile("G:\\eclipse\\workspace.thesis\\data\\MyOntology.owl");
inputSreamfile = new FileInputStream(file);
} catch (FileNotFoundException e) {
e.printStackTrace();
System.out.println("Ontology File is not available...");
}
InputStreamReader in = null;
try {
in = new InputStreamReader(inputSreamfile, "UTF-8");
} catch (UnsupportedEncodingException e) {
e.printStackTrace();
}
// 读取文件
defModel.read(in,null);
// 关闭输入流读取器
try {
in.close();
} catch (IOException e) {
e.printStackTrace();
}
// 执行数据转换，将本体数据存入数据库
defModel.commit();
// 关闭数据库连接
try {
conn.close();
} catch (SQLException e) {
e.printStackTrace();
}
}catch(RDFRDBException e){
System.out.println("Exceptions occur...");
}
}
} // 代码结束

执行程序之后，本体被存入MySQL数据库中。主要数据存在两个表中。
1) ontodatabase.jena_g1t1_stmt 存储了本体的数据信息
2) ontodatabase.jena_sys_stmt 存储了本体的元数据信息
可以通过命令行查看或者使用MySQL GUI客户端工具查看。建议使用后者。
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[1] iMarine http://iMarine.blog.163.com
[2] 对Jena的简单理解和一个例子 http://imarine.blog.163.com/blog/static/51380183200812774739130/
[3] \\Jena-2.5\doc\DB\index.html
[4] \\Jena-2.5\doc\DB\layout.html
[5] \\Jena-2.5\doc\DB\mysql-howto.html